Theoretische Biophysik, SoSe 2025

Vorlesung

1. Woche:
   
   Weiterführende Literatur:
   Zwanzig, Szabo, Bagchi 1992
   Cisneros, Newman, 2014
   Timothy Newman zu Krebs-Metastasen:
   
   Videos zu thermischen Fluktuationen:
   Liquid water ab initio molecular dynamics
   MIT TON: How does salt dissolve in water?
   Water permeation through phospholipid membrane
   Brain Science - Molecular dynamics simulation of a drug entering into a target protein
   
   Videos zu Poteinfaltung:
   Protein folding simulation, from denatured to native state
   A replica exchange MD simulation of the folding of a short protein
   Protein Folding
   
   
2. Woche:
   
   Videos zu Brownscher Bewegung:
   MIT TON: Pollen Grains in Water - Brownian Motion
   Brownian motion 2 (fat globules of milk and pigment particles in watercolour.)
   Brownian Motion - nanoparticles in water
   Brownian motion simulation
   
   Weiterführende Literatur:
   Purcell, 1977
   
   
3. Woche:
   
   Weiterführende Literatur:
   Fuchs, 2015
   
   
4. Woche:
5. Woche:
   
   Weiterführende Literatur:
   Hänggi et al., 1990
   Raible et al., 2006
   Newman et al., 1985
   
   Videos zu chemischen Reaktionen:
   MIT TON: How does salt dissolve in water?
   SPRINT: automatic discovery of chemical reactions
   
   
6. Woche:
   
   Weiterführende Literatur:
   Pusey 2011
   Reimann 2001
   
   
7. Woche:
   
   Friction force microscopy (biophys1.pdf)
   
   Weiterführende Literatur:
   Pusey 2011
   Reimann 2001
   Hasselmann 1976
   Stochastische Resonanz 1
   Stochastische Resonanz 2
   
   Videos:
   DNA Strand through Alpha-hemolysin
   
   
8. Woche:
   
   Video: Wiener process animated
   
   

Literatur